Comisión de garantías. Es el órgano supremo de control de las medidas disciplinarias internas, tanto de carácter individual sobre los afiliados y afiliadas como de carácter colectivo sobre las organizaciones. Interviene además en cuantas reclamaciones le presenta la afiliación o las organizaciones integradas en la Unión sindical, sobre violación de los principio de democracia interna reconocidos en los Estatutos.
Desde nuestro 8º Congreso está compuesta por:

- Jesús Aguinaga Tellería
- Juan Luis Ripero Urra
- José Nilo Arias Parga

Suplentes:

- Marino Ardaiz Jaurrieta
- Amaia Sancha González

Comisión de control administrativo y financiero. Su función es la de controlar el funcionamiento administrativo y financiero de los órganos de la Unión Sindical de CC.OO. de Navarra. Desde el 8º congreso sus miembros son:

- Mª Carmen Antón Remirez
- Félix Abaigar Luquin
- Luis Miguel Asiain Cuevas

Suplentes:

- Mª Teresa Aranguren Urrestarazu
- Eloy Jordán De La Cruz.